1、荧光定量 PCR 仪(ABI7500)操作规程及日常维护曹蕾马扬光施小明【摘 要】介绍了荧光定量 PCR 仪(ABI7500)操作规程,总结了其日常维护和注意事项,为其使用提供指导。【关键词】荧光定量 PCR 仪 操作规程 维护荧光定量 PCR 仪将 PCR 热循环,荧光检测和各种应用分析软件结合在一起,可以动态观察 PCR 每一循环各反应管中 PCR 扩增产物逐渐增加的情况。1 原理介绍实时荧光定量 PCR 技术,是指在 PCR 反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个 PCR 进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法1。荧光染料法:荧光染料能特异性掺人 DNA 双链,
2、发出荧光信号,而不掺入双链中的染料分子不发出荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物增加完全同步1。荧光探针法:探针的 5 端标记荧光报告基团(reporter R)3 端标记淬灭基团(quencher Q),探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;PCR 扩增时,Taq 酶的 5-3 外切酶活性将探针酶切降解,使报告荧光基团和淬灭荧光基团分离,从而荧光监测系统可接收到荧光信号,即每扩增一条 DNA 链,就有一个荧光分子形成,实现了荧光信号的累积与 PCR 产物的形成完全同步1 2。通常,荧光擴增曲线可分为三个阶段,即荧光背景信号阶段、荧光信号指数扩增阶段和平台期。在荧光信号
3、指数扩增阶段,PCR 产物量的对数值与起始模板量之间存在线性关系,因此可以在该阶段进行定量分析。为了便于对所检测样本进行比较,在指数期需要设定一个荧光信号的阈值。荧光信号由本底进入指数增长阶段的阈值所对应的循环次数称为ct 值。模板的 ct 值与其起始拷贝数的对数存在线性关系,起始拷贝数越多,则 ct 值越小。利用已知起始拷贝数的标准品及其相应的 ct 值可绘制出标准曲线,测得未知样品的Ct 值后,根据标准曲线便可准确计算出该样品的起始拷贝数3。2 操作规程2.1 开机2.1.1 依次打开电脑显示器和电脑主机的电源开关,进入 Windows 界面。2.1.2 接着打开 AB7500 仪器电源开
4、关,预热 10 分钟。2.1.3 点击 SDS 软件。2.2 检测2.2.1 选择 File-New-新建,在 New Document Wizard 窗口中,从 Assay 下拉列表中选择反应类型:相对定量,绝对定量,等位基因鉴别或阳性阴性实验,从 Container 下拉列表中选择反应板类型,在 Default Plate Name 中输入反应板文件名,点击 Next,选择需要添加到反应板文件的探针,点击 Next,为每个孔指定探针和任务,单击 Finish。2.2.2 在 Well Inspector-View-Well Inspector 中输入样品名。2.2.3 运行相应的反应类型程
5、序,选择 Instrument 设定 PCR 条件。2.2.4 点击 Save 下拉菜单下的 Save As,输入文件名,点击 save,关闭设置界面。2.2.5 按压仪器托盘上的按压位,待托盘弹出后,将所需检测反应板放入检测孔位,再次按压托盘使其滑入仪器,点击 Start 开始检测。2.3 结果分析PCR 反应结束后自动保存结果,对扩增曲线进行分析,选择 Analysis-AnalysisSettings 选择 Auto Ct,软件自动为每个反应空生成基线和阈值,也可根据分析后图像调节 Baseline 的 Start 值、End 值,Threshold 值,点击 Analyze 进行再次分
6、析。2.4 关机实验结束后取出反应管(切勿打开管盖),顺序关闭 AB7500 软件、定量 PCR 仪电源,关闭电脑3 日常清洁维护43.1 每周用无绒布块蘸取 75%酒精清洁仪器的表面。3.2 每周使用 75%酒精浸泡反应管托架(晾干后放回仪器内)。3.3 每月执行一次背景校准3.4 每半年检查灯具状态。在 7500 Software 中,选择 Instrument-LampStatus/Replacement 以确定卤素灯的状态:Condition 显示 Good 表示灯具工作良好,不需更换卤素灯;显示 Failed 表示卤素灯已坏,需更换;Change Soon 表示灯具使用超过 2000
7、 小时,建议将更换。3.5 在 PCR 仪运行之前或期间,7500 Software 可能显示警告,按警告要求进行目标区(ROI)校正、背景校准、光学校准、染料校准、RNase P 仪器验证试验等。参考文献1 钟江华,张光萍,柳小英.实时荧光定量 PCR 技术的研究进展与应用J.氨基酸和生物资源,2011,33(2):6872.2 兰静,李秋根.实时荧光定量 PCR 技术理论研究及其在医学方面的应用J.南昌大学学报(医学版),2011,51(10):97100.3 王志平.荧光定量 PCR 技术的原理与应用J.渭南师范学院学报,2012,27(10):6164.4 魏建新.ABI7500 型荧光定量 PCR 仪的使用维护及故障排除J.中国卫生检验杂志,2015,25(21):37803781.